川崎医学会誌 » A new method for determining HCV RNA genotype using 5′ UTR sequence *

5'非翻訳領域の塩基配列の組み合わせによる HCV genotype の新しい測定法

　HCV genotypeの分類は，ウィルス量とともにＣ型肝炎治療におけるインターフェロン治療効果の予測にきわめて重要である．遺伝子型の分類にはＨＣＶのコア領域を型特異的プライマーによるＰＣＲを行って診断する方法や，免疫血清学的にELISA法を用いた分類が一般的である．しかし，ウィルス量が少ない血清においては遺伝子型の分類が不十分である．今回，アンプリコアＨＣＶモニターv 20にて得られたＰＣＲ産物のダイレクトシークエンシングによる5’非翻訳領域(5' Untranslated region ； 5'UTR)の塩基配列の検討により，遺伝子型を正確に診断できる方法を考案した．諸種のＨＣＶ陽性血清290検体を用い，この方法(5'UTR genotype法）によりgenotypeの分類を行い, type-specific ＰＣＲ法（岡本法）や, serogroup分類(Kohara法）との対比を行った. Genotypeは, 5'UTRの-167, -163, -161の３個所の塩基の組み合わせにより，1ｂはT, A, G, 2aはT, G,G, 2 bはT, G, Aに相当することが明らかとなった．岡本法と本法との対比では290検体中289検体(99.7%)に合致していた．一方, serogroup分類では，41検体(14.1%)に型分類判定不能とされたものがあったが，本法ではこれらの検体についても正確に型分類が可能であった．各型別の血清を段階希釈し，本法によるｇｅｎｏtype判定可能なウィルス量について検討したところ，いずれの型においても100 copy/ml 前後のウィルス量までは判定可能であった．本法は一度の検査でHCV ＲＮＡ定量とgenotype分類が同時に測定しうる有用な方法であると思われる．　　　　　　　　　　　　　　　（平成13年８月18日受理）

著者名: 都築昌之
巻: 27
号: 3
頁: 193-200
DOI: 10.11482/KMJ27(3)193-200.2001.pdf